通风机控制器是通风机上方的微电脑控制器。利用微机进行复杂的逻辑计算与控制，对通风机上各种机电设备的运行进行管理。并利用传感器去除呼吸机的物理参数，供操作者使用。微机的使用大大提高了各种设备的运行可靠性，简化了系统设备的复杂性。设计采用PID控制，使排风风速稳定在用户设定的风速范围内。由于液晶显示器的使用，操作简单直观。多种工作方式(待机、强制排风、人/无人排气)使该装置更加节能实用。先进的风速标定方法能更准确地检测出实际风速，从而实现实时准确的排风控制。

  柜控制器电路的主要功能是完成对外界环境的输入，如人的输入、窗口的打开、反馈输入和手动输入。通过判断和计算，输出一定的电压控制文丘里阀，形成闭环控制。控制器通过RS 485总线将当前排气柜的排气量传递给风补偿控制器，通过Modbus协议与上位机通信，采用RS 485总线形式，选用RSM 485低功耗芯片进行电平转换。在监控和参数设置的实施中，可以分批进行，大大简化了操作量。上位机软件可以用labview或VB开发。